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強勢來襲!基因測序「新貴」將深耕中國市場

2008年,有公司曾預計,5年後,個人基因組的測序將在15分鐘內完成,費用低於1000美元,人人都可以消費得起。這種說法當時被許多人認為是「不可能的任務」,然而,如今這個預言已經實現。

3月26日,Nanopore研討會在上海召開,Oxford Nanopore公司首席執行官戈登·桑格拉(Gordon Sanghera)、江蘇先聲醫學診斷有限公司產品總監塗浩波、北京希望組生物科技有限公司CEO汪德鵬出席會議,並就當前基因測序技術進行了探討。

「我們是全球唯一一家能夠做到實時測量的公司,我們的目標是讓任何人都能在任何環境下分析任何生物。未來,我們相信,牛津納米的技術可以被廣泛應用,除了用於尋找病毒種類,也可以被應用於農業及教育領域。」Gordon Sanghera在接受39健康網採訪時表示,現在DNA測序儀設備在往攜帶型的方向發展,Oxford Nanopore公司(英國牛津納米孔公司)一直在做的就是可以讓用戶花費很少的成本進行測序,並且任何人都可以使用公司的裝置進行測序,此外,裝置大小可以依據實驗需求的變化而改變。

Oxford Nanopore公司首席執行官戈登·桑格拉(Gordon Sanghera)

便攜、低成本!基因測序界殺出「黑馬」

基因測序儀是基因行業上游的核心,如同電腦中的CPU一樣重要。近年來,隨著基因測序產業飛速發展,新產品層出不窮,測序儀器也不斷向小型化、智能化方向發展,納米孔測序技術的出現,更是標誌著測序技術未來的發展方向。

據39健康網了解,納米孔測序是國際上最受人關注的測序技術之一。其創新的電信號檢測和單分子長鏈測序讓全世界的科研工作者翹首以待。

作為納米孔技術的領跑者,Oxford Nanopore公司成功研發了世界上首例且唯一的納米孔DNA/RNA測序儀,規避了第二代基因測序技術所面臨的讀長短以及無法解決高度雜合的基因組、高度重複序列、高GC區域、拷貝數變異、大的結構變異等缺陷。

納米孔測序的工作原理是將DNA的一條鏈通過納米級的小孔(nanopore),與此同時,納米孔上會通過離子電流,DNA或RNA的序列由核酸鏈依次通過小孔過程中電流的變化決定。不同於其他測序技術,Oxford Nanopore公司的技術不需要將基因組提前打斷成數百萬個幾百個鹼基長的片段,也不需要進行文庫構建,這使得即便使用手掌大小的測序儀也能夠快速、經濟地生產出長達上萬個鹼基的讀長。目前,來自全世界的科學家們正在嘗試使用納米孔測序儀測出第一條長達100萬個鹼基讀長的序列。此外,該款測序儀還能夠用於直接讀取RNA和cDNA序列,測通轉錄本的全長。

實時、快速、簡單、可拓展多重採樣、直接分析、高質量共識數據,這些特徵無不彰顯出納米孔測序的巨大潛力。

塗浩波介紹,Oxford Nanopore這一技術平台相較於其他的測序平台有巨大的優勢:第一,長度長,對於微生物鑒定有非常大的幫助;第二,可以實時檢測、實時分析;第三,具有便攜性,目前,世界上沒有第二台這樣便攜性的儀器可在市場上使用。而利用這些優勢,我們可以在臨床醫院做到床床檢測,甚至是國家應急監控實時在現場鑒定疫情爆發的源頭,進行實時地分析。

「所有生物都有DNA,我們都會好奇是什麼樣的DNA,它是否在發生變化,是否健康。例如,現在就有某種病毒正在攻擊非洲生長的某種農作物,他們就在實地使用我們的產品MinION協助預防及解決這個情況。所以,如果擁有實時DNA信息,那麼就可以實現『生物聯網』(Internet of Living Things)。這與我們公司的遠大願景非常吻合:讓任何人在任何地方都可以獲取 DNA 信息。」 Gordon Sanghera補充道。

中國成基因測序最大市場

作為醫療健康行業的火爆技術,基因測序近年來越來越得到臨床的認可,並逐步被應用到各大領域中。而隨著牛津納米孔測序儀的產品需求日益增長,公司目前已經擴大其服務範圍至全球70多個國家。而在Oxford Nanopore公司的服務供應商名單中也不乏中國本土企業的身影。

作為Nanopore公司的參投企業和合作夥伴,先聲葯業早在2016年投資並引進了國際領先的ONT Nanopore納米孔測序平台。先聲葯業集團下屬的子公司先聲診斷基於Nanopore納米孔測序技術平台,經過大量自主研發,已建立起一套有效的病原體快速精準診斷和耐葯分析方法,並且基於不同樣本類型進行了相關方法學驗證,取得了良好的階段性成果。

「先聲製藥是做藥物研發的企業,藥物的研發現在更多的是精準用藥。它是兩個方面,一是針對現有藥物進行精準篩選找到更精準的病人;另外,利用基因測序技術,能夠在新葯研發過程中,在臨床實驗階段去篩選合適的入組病人,去幫助更好地評估藥效。在這一方面,Nanopore納米孔測序平台可以通過技術開發,幫助先聲集團的製藥部分更好地開發更加適合於臨床病患的新葯,這也是我們的目標。」塗浩波強調。

據39健康網了解,目前,先聲診斷已經在國際上率先實現了利用Nanopore納米孔測序平台對感染性心內膜炎病原體的宏基因組檢測,以及對登革熱病毒感染等臨床樣本的宏基因組檢測。後續,先聲診斷還將在Nanopore平台上開發針對複雜臨床進行病原微生物鑒定和耐葯分析的臨床解決方案。

2018年1月17日,武漢未來組生物科技有限公司已通過Oxford Nanopore官方認證,獲得Nanopore DNA測序認證服務供應商資質,屬於中國首家,世界第一批。該公司現已面向中國和包括英國、美國在內的海外市場合作夥伴提供nanopore測序服務。除了能夠提供納米孔測序全系列的技術應用服務外,該公司在面對較複雜的樣本如植物和昆蟲時,也能得出令人滿意的結果。

汪德鵬先生表示:「我們發現Oxford Nanopore的優勢非常明顯,它的成本比二代測序更低,一台機器產生的數據比二代測序更多。這意味著三代測序可能在接下來的兩三年成為主流的測序手段,所以我們毫不猶豫地朝這一方向努力。」

這些案例無疑讓Oxford Nanopore公司對在中國市場的發展更有信心。

「目前全球共有12500個大型主機序列,自2015年以來,我們已經售出6000個MinION產品,在接下來的6個月,我們預計會有1000-2000個MinION銷售到中國。1000美金的價格對於做DNA測序的人而言可以說是非常便宜。在看到中國的基因變革後,我們認為中國善於接受和擁抱創新和飛越性的技術,未來中國市場將是我們最大的基因測序市場。」Gordon Sanghera表示。

來源:基因谷


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