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科學家為腸道細菌編寫分子食譜

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科學家們編寫了一本不同尋常的食譜,不僅適用於我們人類,而且是專門為我們體內的微生物寫的。

市面上有各種食譜,但這是第一本關於腸道細菌的食譜。

過去,科學家們發表的往往都是關於以前未知的機制或過程的複雜論文。而現在,科學家們近日在《Nature Microbiology》上發表了一種新形式的研究成果:在實驗室中成功培養和研究腸道細菌的「食譜」。這項工作將幫助全世界的研究人員提升對腸道細菌的理解。

越來越多的研究都表明腸道細菌對我們的健康非常重要,有的研究發現,腸道細菌在防止疾病、修復損傷,甚至是調節基因方面都發揮著作用。然而,我們對這些情況是如何發生的知之甚少。我們不知道腸道細菌如何生長,如何代謝營養物質,我們甚至不知道它們喜歡什麼樣的食物。

歐洲分子生物學小組的Nassos Typas和同事們在最近的這項研究中回答了這一問題。Typas和Peer Bork以及Kiran Patil一起,選擇了人類腸道中最常見的細菌以及某些與腸道疾病(比如結腸直腸和炎性腸病)相關的菌種進行了研究,總共涉及72個菌種的96個菌株以及19種不同的生長環境。

他們對這些細菌的營養偏好、消化和產生特定分子的能力等特徵進行了研究。由於這些過程經常發生在腸道細菌的研究中,所以研究結果非常令人驚訝。

Kiran Patil:「我們驚訝地發現了一種能夠利用粘蛋白的新細菌。粘蛋白是能夠生成粘液的蛋白質。這些細菌會通過削弱腸道中的保護性粘液屏障的方式促成炎症和感染。另一個意外來自於一種細菌,這種細菌會被生長培養基中最常見成分氨基酸和短鏈脂肪酸抑制,而這都是生長培養基中最常見的成分。結果表明,富含多種營養物質的培養基可能對某些細菌是有毒的,而我們通常卻認為:吃得越多越好。」

另一個讓人驚訝的是,研究人員發現,即使關係密切的細菌也可能擁有不同的營養偏好,這表明單靠細菌的基因無法預測它喜歡「吃什麼」。

這本科學的「食譜」中記錄了很多如何培養腸道細菌的分子配方,研究人員希望利用它來向科學界提供研究人類腸道微生物結構和功能的有效工具。很明顯,我們還需要更多的研究才能夠徹底地理解腸道細菌的作用和影響,而這項發現可能是未來此類研究的重要里程碑。

Nassos Typas說:「我們的成果為科學家們提供了進行實驗研究腸道微生物生態的工具,不僅僅是發現相關性,更可以確定因果關係。」

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