《Nature》子刊提出腸道菌群研究警告：需要考慮抗生素的影響
「抗生素在我們實驗室的組織培養和細胞培養中使用得很多，所以如果抗生素引發抗病毒防禦和基因調控，這意味著如果您想要研究抗病毒反應，當使用了這些抗生素的時候，就必須小心將它們的影響從實驗研究中剔除。」
上周，康涅狄格大學的病毒學家Paulo Verardi在自己辦公室不小心弄傷了手，急忙在抽屜里尋找Neosporin（一種抗生素軟膏），這讓他想起了這種軟膏的真正作用。就在同一天，Verardi閱讀文獻時，看到了一項新研究發現，利用被稱為氨基糖苷類（aminoglycosides）的抗生素類藥物（包括新黴素，也就是Neosorin中的抗生素）局部治療小鼠，可以幫助它們抵禦一些病毒的感染。
「這讓我們意識到任何藥物都可能產生脫靶效應，包括抗生素，」他解釋說。
在這項最新研究中，耶魯大學的免疫學家Akiko Iwasaki指出，這些藥物會誘導宿主基因表達發生改變，刺激使用這些藥物抵禦病毒病原體的區域的先天免疫反應。
這一研究成果公布在Nature Microbiology雜誌上。
「這項研究確實發現了抗生素對病毒性疾病的一種意外影響，」Iwasaki說。
此前曾有研究分析過抗生素對動物或培養細胞病毒感染的影響，結果差異很大，從急劇下降到增加的都有，這取決於所用的特定抗生素和病毒。在一些研究中，抗生素對腸道微生物群的影響似乎可以解釋易感性的變化。
Iwasaki研究小組之前發現，用抗生素口服雞尾酒治療小鼠會使其更容易感染流感病毒。在這項新研究中，他們希望分析局部抗生素治療是否會影響小鼠對單純皰疹病毒（HSV）的反應。研究人員用抗生素混合物處理小鼠的陰道粘膜2-6天，然後讓它們接觸病毒。
結果顯示，與未治療的對照組相比，經抗生素治療的小鼠最初在其粘膜中出現了較少的病毒複製，儘管在幾天後這些小鼠的病毒水平接近於對照組，但還是不會發展成嚴重的疾病。
之後研究組成員又試用了一種抗生素而不是雞尾酒混合之勞，發現只有新黴素才能產生抗病毒作用。為了觀察這種保護作用是否是由於細菌死亡，他們嘗試了無菌小鼠（缺乏腸道微生物群）實驗，結果相似。
文章的另外一位作者Smita Gopinath想知道抗生素是否對哺乳動物宿主細胞有影響，因此比對了新黴素處理的小鼠陰道細胞中的基因表達，以及對照組中的基因表達。
他們發現新黴素增加了宿主中一些基因的活性，特別是與有助於對抗病毒攻擊的干擾素家族信號蛋白相關的一類先天免疫應答的活性。研究小組發現新黴素對培養的人類細胞中的基因表達具有相似的作用。
「我認為這實際上是一項非常重要的研究，」因為它表明這種藥物直接作用於宿主細胞，蒙特利爾大學的生物化學家Nathalie Grandvaux說。
「這一結果指出抗生素不僅對細菌或微生物群產生影響。 。 。也對基因表達產生這些普遍效應「，Verardi說，」這可能會影響免疫力，是正面影響還是負面影響取決於施用途徑，病原體和與微生物群的相互作用等方面的因素。
Iwasaki警告說，這項研究不應該被用作辯護新黴素之類抗生素在臨床上可以用作抗病毒藥物的證據，因為「殺死良好的共生細菌的影響可能比你試圖對抗病毒更有害」。相反，她建議深入了解抗生素如何誘導抗病毒反應，可幫助開發出一種複製該效應而不破壞微生物群的藥物。
Grandvaux說，這項研究可能對一些科學家如何開展他們的研究有更直接的影響。
「抗生素在我們實驗室的組織培養和細胞培養中使用得很多，所以如果抗生素引發抗病毒防禦和基因調控，這意味著如果您想要研究抗病毒反應，當使用了這些抗生素的時候，就必須小心將它們的影響從實驗研究中剔除。」
同樣，耶魯大學的Noah Palm也指出，為了研究微生物組的作用，在動物實驗中需要謹慎使用抗生素來消除腸道細菌。
原文標題
Topical application of aminoglycoside antibiotics enhances host resistance to viral infections in a microbiota-independent manner
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