浙江大學郭國驥剛發完Cell，現在又下一城，在單細胞測序領域取得重大進展

iNature：2018年2月23日，浙江大學郭國驥及韓曉平研究組在國際頂級期刊Cell在線發表題為「Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq」的研究論文，該論文建立了基於網路的「單細胞MCA分析」管道，可根據單細胞數字表達式準確定義細胞類型。郭國驥及韓曉平研究組的研究證明了Microwell-seq技術和MCA資源的廣泛適用性（點擊閱讀）。而不到短短一個多月的時間，2018年4月5日，浙江大學郭國驥研究組等人又在Genome Biology上在線發表了題為「Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput single-cell RNA-sequencing」的研究論文，使用基於優化的微流體迴路的高通量單細胞RNA測序（scRNA-seq）來鑒定人類胚狀體系統中的早期分化譜系，發現了與血源性內皮細胞發育有關的基因H9。從功能上來說，H9顯示比引發細胞更高的分化為造血譜系的效力。揭示了hPSC早期分化的細胞狀態景觀，提供了可用於優化分化方案的新見解。

人多能幹細胞（hPSCs）為研究細胞分化和再生醫學細胞的無限來源提供了強大的模型。然而，尚未實現針對hPSC的全面的單細胞水平差異化路線圖。

關於hPSC早期分化的scRNA-seq分析概述

研究人員使用基於優化的微流體迴路的高通量單細胞RNA測序（scRNA-seq）來鑒定人類胚狀體系統中的早期分化譜系。提出了hPSC早期分化的細胞狀態景觀，涵蓋了多種細胞譜系，包括神經，肌肉，內皮，基質，肝臟和上皮細胞。通過假設分析，研究人員構建了這些祖細胞的發育軌跡，揭示了細胞分化過程中的基因表達動態。

scRNA-seq分析顯示了EB中的祖細胞譜系

同時，研究人員還進一步將啟動的H9細胞重編程為na?ve-like H9細胞，以研究細胞狀態轉變過程。研究人員發現與血管內皮細胞發育相關的基因在na?ve-like H9細胞的基因中富集。從功能上來說，na?ve-like H9細胞顯示比原始細胞更高的分化為造血譜系的效力。

EBs模擬體內早期發育

該研究的單細胞分析揭示了hPSC早期分化的細胞狀態景觀，提供了可用於優化分化方案的新見解。

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