Cancer Cell:為什麼每個人的腫瘤都不一樣?RNA編輯或是幕後黑手
本文亮點:1)直接評估腫瘤組織中A-I的RNA編輯對蛋白組學多樣性的影響;2)採用了一種更強大的計算機策略檢測RNA編輯產生的各種多肽;3)獨立的實驗性證據表明RNA編輯誘導腫瘤中各種突變多肽;4)COPA編輯對癌細胞增殖、遷移和侵襲的影響。
圖片來源:Cancer Cell
腺苷(A)到肌苷(I)的RNA編輯給腫瘤轉錄組學中引入了許多核苷酸改變。但是由於轉錄後調節的複雜性,我們迄今為止仍然不知道RNA編輯對人類腫瘤中蛋白組學的多樣性的影響。
為了解釋這個問題,來自德州大學安德森癌症中心的科學家們在生物信息和計算生物學系副教授Han Liang、系統生物學系主任Gordon Mills教授的帶領下對TCGA中的基因組學數據和CPTAC中的蛋白組學數據進行了綜合分析。儘管收集數據的站點有限,但是研究人員還是發現A-I的RNA編輯可以通過改變氨基酸序列來改變了人類乳腺癌中的蛋白組學多樣性。
研究人員在RNA和蛋白質水平確認了存在編輯,而編輯過的COPA蛋白質會增強癌細胞在體外的增殖、遷移和侵襲能力。
總體來看,該研究表明了A-I的RNA編輯在腫瘤蛋白組學多樣性中做出了重要貢獻,同時強調了這一發現的臨床轉化價值。
參考資料:Gordon B. Mills et al.A-to-I RNA Editing Contributes to Proteomic Diversity in Cancer.Cancer Cell.DOI: https://doi.org/10.1016/j.ccell.2018.03.026
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