翼和生物細胞鑒定技術論文叕發Cancer Research
翼和生物細胞鑒定技術論文叕發Cancer Research
一、文獻來源:DOI:10.1158/0008-5472.CAN-17-2314,Cancer Research ·March 12, 2018影響因子8.5
二、蛋白酪氨酸激酶src基因家族:上一篇發在CancerResearch上涉及的表皮生長因子EGFR是受體型酪氨酸激酶,非受體型以src基因家族為代表,在癌症發生髮展中起重要作用。這篇文章證明了Src與細胞膜的聯繫與失聯、催化激活與失活軍受到蛋白質乙醯化修飾的調控。
三、蛋白質翻譯後修飾
蛋白質翻譯後修飾是蛋白質功能調節的重要方式。分為可逆與不可逆兩種方式。不可逆的如C端的甲基化,而磷酸化,N端甲基化與乙醯化屬於可逆修飾,隨細胞生理狀態而改變,起到信號傳遞、酶原激活作用。
圖Src CD-loop區激活與失活位點
正文
模型:膠質瘤。
研究手段:
1.細胞鑒定
上海翼和生物幫助作者對文章涉及的HEK293T人源進行了STR鑒定,而後又對NIH3T3, SYF與MEF等細胞系進行了鼠源鑒定。
2.主要結果
作者證明了Src從細胞膜下來去其他細胞器或細胞核,是通過CBP蛋白乙醯化Src的N端的賴氨酸簇。而Src激活STAT3活性的功能是通過刺激C端的賴氨酸簇。乙醯化的Src明顯促進了癌症細胞的增殖。
細胞系鑒定FAQ
1.什麼是細胞系鑒定?
所謂細胞系鑒定即通過STR(短串聯重複)圖譜所建立細胞系的遺傳特徵。一株細胞系的遺傳特徵確立後,細胞系可以通過定期的檢測,以防止出現細胞系被誤認或交叉污染的情況。
2.為什麼要進行細胞系鑒定?
由於細胞系發生交叉污染或身份誤認,將導致實驗數據的無效或數據誤導。NIH已發出公告,討論細胞系鑒定的必要性與重要性,並且越來越多的的期刊要求文章發表前、需提供細胞鑒定數據。
3.細胞系用錯的概率有多大?
據ATCC估計,1977年錯誤使用細胞的概率是16%,1999年是18%。根據我們的經驗,國內細胞系用錯的概率不低於20%。即如果一個研究所有二十個課題組,按概率估計,有4個課題組用的細胞是錯的。
4.什麼細胞最容易污染別的細胞?
Hela細胞。因為她長得快、長得好嘛。當你發現自己的一個培養瓶里的細胞突然長得很好,而以後都用它傳代做實驗的話,十之八九是搞錯了。
5.有哪些細胞曾被Hela污染
lnt-407、HEp-2、WISH等一百餘種。.
6.如何進行細胞系鑒定
細胞系鑒定目前主要基於國際身份認證委員會的標準。依據該標準,可以通過多重熒光PCR技術,對人源8個STR位點以及1個性別決定位點進行檢測。下表為這些位點的具體的遺傳信息。
7.什麼時候需細胞系鑒定
u當建立或獲得一個新的細胞系時;
u一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時
u在細胞凍存之前,或細胞已連續培養2~3個月時
u發表文章或申請課題經費前
u細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大時
u當實驗室使用超過一種細胞系時,所有細胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能
8.如何提供鑒定樣本
每種細胞需單獨收集在1.5ml離心管中,細胞數目不少於106個。細胞需要離心沉澱,並且以PBS清洗儘可能去除上清培養基,沉澱沉澱進行冰凍保存與寄送。
9.如何知道細胞系是否發生交叉污染了
如果存在細胞系之間發生交叉污染,而且鑒定用的細胞可能有兩種以上的細胞系時,那麼在進行STR位點檢測的時候,多個位點會出現兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關係。因此,存在交叉污染的混合細胞系中,其中一個位點中某些峰會明顯高於其他的峰,其中大峰是屬於混合細胞系中那個主要細胞系,而小峰則屬於那個次要細胞系。
值得注意的是,當發生兩個或以上細胞混合的時候,檢測結果看起來非常像細胞系的「遺傳不穩定」——當一個細胞系存在亞群時,尤其是一些癌細胞系,由於遺傳不穩定的存在,在一些位點的STR特性會不同。因此經驗豐富的分子專家是非常重要的,他能夠幫助分析複雜的電泳圖譜(STR峰圖),從而判斷是否由於發生細胞系交叉污染而導致多等位基因情況。上海翼和應用生物,作為老牌的遺傳技術服務公司,十年以上基因分型經驗,可以幫你解決你的疑惑。
10.如何進行資料庫比對
(1).Cell Line Integrated Molecular Authentication (CLIMA)
http://bioinformatics.hsanmartino.it/clima/
(2).American Type Culture Collection (ATCC)
https://www.atcc.org/CulturesandProducts/CellBiology/STRProfileDatabase/tabid/174/Default.asx
(3).Japanese Collection of Research Bioresource (JCRB)
(4).German Collection of Microorganisms and Cell Cultures(DSMZ)
http://www.dsmz.de/human_and_animal_cell_lines/main.php?contentleft_id=101
11.如何根據STR數據判斷細胞系的身份
收到細胞系鑒定結果以及STR信息,可以與參考資料庫進行比對。如果細胞樣本的每個STR位點和參考細胞STR位點都能重合匹配,即說明該細胞系正確,反之則說明你的細胞系可能被錯誤標記,交叉污染或發生遺傳不穩定。一般說來,匹配度≥80%即可認為該細胞系正確,匹配度<80%則說明該細胞系的來源需要被懷疑。
如果細胞系被鑒定出發生交叉污染或錯誤標記,則需要拿更早代數的細胞進行鑒定,從而找到問題的起源或者直接從可靠的機構購買一株新的細胞系。
12.如果細胞系沒有在資料庫中比對出結果怎麼辦
如果已知資料庫中沒有找到你的細胞信息,你可以用自己的細胞遺傳信息建立自己的遺傳特性,以便後期進行自己細胞庫的比對。
13.細胞系交叉污染或錯誤鑒定對研究是否有影響
答案是肯定的。使用錯誤的細胞系或者是被污染的細胞系做研究,只會造成時間,金錢和精力的損失,以及造成實驗結果的不一致和不可重複。因此如果用被污染或錯誤的細胞系做研究,在發表文章或做進一步研究時極有可能需要用正確的細胞再重複實驗。
14.全球因為細胞系用錯浪費了多少錢?
據不完全統計,僅就HEp-2與Int-407這兩株細胞(它們實際上是Hela),直接浪費的投入是7億美金,間接浪費了7億美金。
15.因為用錯細胞,產生了多少垃圾文章?
據不完全統計,僅就HEp-2與Int-407這兩株細胞(它們實際上是Hela),前者發表了近6000篇SCI(17萬次引用),後者發表了近1400篇SCI。都是垃圾文章。
16.我覺得我的細胞是正確的,為什麼你說是錯的呢?
好吧。瑞典有一個科學家,在三十年的時間裡都以為自己的細胞是正確的,直到做了細胞鑒定之後發現是錯誤的。越早發現錯誤越好,鑒定之後是正確的話,自己也放心。
17.翼和為何使用STR圖譜進行人源細胞鑒定?
翼和的STR圖譜鑒定里有細胞身份驗證報告、STR等位基因表、電泳圖、結果的解釋與資料庫比對結果。就這一服務本身而言,是非常專業的。
18.翼和資質
細胞鑒定哪家強,上海翼和應用生物技術有限公司。本公司最多可提供20於對STR引物,對細胞進行鑒定。無論是小鼠、大鼠、人我們都能區分。
翼和資質:上海市遺傳學會理事單位、國際細胞系認證委員會成員
關鍵價格超便宜,為您第一時間鑒定細胞來源。
上海翼和應用生物技術有限公司
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