Nature子刊:50萬數據繪製史上最全房顫基因譜!
乾貨 | 靠譜 | 實用
作者:Ruthy,Zoe
導 讀
心房纖顫(AF)是最常見的心律失常之一,發病時心房呈無序激動和無效收縮的房性節律,發病率高,持續時間長,還可引起嚴重的併發症,導致病人殘疾或病死率增加。現今,AF的治療手段以病因治療為主呈百花齊放狀態,但針對其發病根源的研究進步緩慢。近期,《Nature Genetics》上發表了一項迄今為止最大的AF薈萃分析結果,通過全基因組分析揭示了幾十個新的遺傳風險因素,進一步擴大了AF的基因譜。
數據顯示,目前全球受AF影響的患者已超3300萬人。AF的病因多種多樣,但其自身具有複雜的遺傳性,因此,AF基因層面的相關研究對從根源上了解AF風險變異至關重要。在題為《Multi-ethnic genome-wide association study for atrial fibrillation》的文章中,研究人員進行了一項AF全基因組關聯研究(GWAS),這是目前最大的AF薈萃分析。
他們收集了50多萬人的心臟健康數據,其中包含65,446名AF病人,AF樣本由84.2%的歐洲人,12.5%的日本人,2%的非裔美國人和1.3%的巴西人和西班牙裔人口組成。
研究人員通過聯合血統薈萃分析,確定了97個與AF顯著相關的基因座,包括67個在組合血統分析中發現的新基因座,還在歐洲特異性分析中發現3個特異性新基因座。同時他們通過轉錄組分析,確定了57個AF相關基因,其中42個與GWAS基因座重疊。這些結果加深了研究人員對AF基礎生物學途徑的理解,並可能有助於AF的治療手段的發展。
曼哈頓的聯合血統薈萃分析結果
在97個AF顯著相關的基因座中,研究人員發現SCN5A和KCNH2這兩個AF基因座中含有抗心律失常藥物的主要靶標基因。SCN5A可編碼心臟中的鈉通道,是鈉通道阻滯劑如氟卡尼和普羅帕酮的靶標,而KCNH2可編碼鉀通道複合物的α亞基,是鉀通道抑製藥物如胺碘酮,索他洛爾和多非利特的靶標。
轉錄組分析結果
其次,研究人員發現轉錄調控是控制AF發病的關鍵因素。TBX3和TBX5編碼的轉錄因子可以調節心臟傳導系統的發育,而NKX2-5編碼的轉錄因子是心臟發育的早期信號,並與先天性心臟病和心率有關。此外,由PITX2編碼的轉錄因子的功能降低與成人AF、左心房動作電位的縮短和鈉通道阻滯劑治療的調節有關。這就說明由TBX5和PITX2編碼的轉錄調控網路對心房發育至關重要。
AF風險變異與危險因素的跨性別關聯
在此基礎上,研究人員進行了進一步的轉錄組分析,結果顯示當AF發生時,相關基因PRRX1的表達降低,而TBX5和KCNJ5的表達增加,這些發現支持了PRRX1,TBX5和KCNJ5在AF中的作用。同時,他們還發現許多新的基因座內含有心律失常綜合征的相關基因。
其中,CASQ2突變可導致兒茶酚胺能多形性室性心動過速,PKP2的致病變體可損害心肌細胞通訊和結構完整性,是心律失常性右心室心肌病的常見原因,而GJA5,KCNH2,SCN5A,KCNJ2,MYH7和NKX2-5已被證明與各種遺傳性心律失常、心肌病或心血管傳導系統疾病相關。
這項迄今為止最大的AF薈萃分析,將AF相關的基因座數量增加了三倍以上,擴大了AF相關基因譜,為進一步評估AF風險位點及相關基因功能奠定了基礎。同時,這項研究結果還拓寬了研究人員對AF所涉及的生物學途徑的理解,並可能有助於AF的治療方法的進一步發展。
參考文獻:
Multi-ethnic genome-wide association study for atrial fibrillation
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