木衛三在其形成之後內核還保存了大部分的熱量

木衛三可能由木星次星雲——即在木星形成之後環繞於其四周的、由氣體和塵埃組成的圓盤——的吸積作用所產生木衛三的吸積過程持續了大約1萬年，相較暗的尼克爾森區和較亮的哈帕吉亞槽溝之間可謂涇渭分明。

較於木衛四的10萬年短得多。當伽利略衛星開始形成之際，木星次星雲中所含的氣體成分已經相對較少；這導致了木衛四較長的吸積時間。相反，由於木衛三是緊接木星之後形成的，這時的次星雲還比較濃密，所以其吸積作用所耗時間較短。相對較短的形成時間使得吸積過程中產生的熱量較少逃逸，這些未逃逸的熱量導致了冰體的融化和木衛三內部結構的分化：即岩石和冰體相互分開，岩石沉入星體中心形成內核。在這方面，木衛三與木衛四不同，後者由於其較長的形成時間而導致吸積熱逃逸殆盡，從而無法在初期融化冰體以及分化內部結構。這一假說揭示了為何質量和構成物質如此接近的兩顆衛星看起來卻如此得不同。

在其形成之後，木衛三的內核還保存了大部分在吸積過程和分化過程中形成的熱量，它只是緩慢的將少量熱量釋放至冰質地幔層中，就如同熱電池的運作一般。接著，地幔又通過對流作用將熱量傳導至星體表面。不久岩石中蘊含的放射性元素開始衰變，產生的熱量進一步加熱了內核，從而加劇了其內部結構的分化，最終形成了一個鐵-硫化亞鐵內核和一個硅酸鹽地幔。至此，木衛三內部結構徹底分化。與之相比較，未經內部結構分化的木衛四所產生的放射性熱能只能導致其冰質內部的對流，這種對流有效地冷卻了星體，並阻止了大規模的冰體融化和內部結構的快速分化，同時其最多只能引起冰體與岩石的部分分化。現今，木衛三的冷卻過程仍十分緩慢。從起內核和硅酸鹽地幔所釋放出的熱量使得木衛三上的地下海洋得以存在，同時只是緩慢冷卻的流動的鐵-硫化亞鐵內核仍在推動星體內的熱對流，並維持著磁圈的存在。木衛三的對外熱通量很可能高於木衛四。

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