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大數據分析或能鑒別指示機體健康和疾病發生的特殊脂質分子

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日前,兩篇刊登在國際雜誌Cell Systems上的研究報告中,來自瑞士洛桑聯邦理工學院的科學家們通過進行大數據分析鑒別出了特殊的脂質或能作為機體健康和疾病的標記。儘管脂質非常重要,但從傳統角度上來講其是科學家們最難進行研究的生物分子,因為脂質分子結構具有一定的多樣性,通過已經定義好的標準結構和指導DNA、RNA和蛋白質的簡單規則似乎並不能確定脂質分子的結構,脂質分子的多樣性也就意味著,並不像建立和分析基因組及轉錄組資料庫,針對脂質分子需要更為個性化的分析步驟。

圖片來源:roswellpark.org

這項研究中,研究人員通過研究對小鼠血液和肝臟中將近150種脂質分子進行了測定,隨後研究人員還鑒別出了每一種脂質分子的遺傳調節子以及其相應的生理學功能。研究者利用系統遺傳學的方法將脂質組學資料庫同來自小鼠機體其它的「組學」資料庫相結合,包括表型組、轉錄組和蛋白質組資料庫等,這種方法就能夠有效識別出不同血脂類的血漿和血脂,並以此作為指示機體健康狀態的標誌物。

比如,研究者就發現,7種血漿甘油三酯或許就能作為健康或脂肪肝,以及非酒精性脂肪肝(NAFLD)的標誌;研究人員或許就能在獨立飲食的NAFLD小鼠模型和NAFLD患者的血漿中證實上述觀察結果。Johan Auwerx博士表示,我們發現,脂質分子或能作為一種特殊的生物標誌物,來替代當前用來診斷諸如NAFLD等疾病的侵入性組織活檢技術。

在另外一項研究中,研究人員鑒別出了一類心磷脂或許能作為指示機體健康或脂肪肝的標誌物,心磷脂是線粒體內膜上存在的一種必要的磷脂類分子。研究者表示,多個遺傳位點或許都能調節脂質的產生,通過將來自小鼠的遺傳數據與來自人類脂質障礙的全基因組關聯性研究的數據進行對比,研究人員就能鑒別出小鼠和人類機體中能調節脂質產生的常見基因。

最後研究者Auwerx說道,分析脂質分子並且發現其特殊的生理性角色可能永遠並不會像研究核酸或蛋白質那樣簡單,但相關的研究結果或能幫助我們深入理解脂質分子的遺傳調節機制和生理學重要性,同時也能展現出科學家們利用大數據來解決生物學和臨床問題的潛能。

原始出處:

Pooja Jha, Molly T. McDevitt, Rahul Gupta, et al. Systems Analyses Reveal Physiological Roles and Genetic Regulators of Liver Lipid Species. Cell Systems (2018) doi:10.1016/j.cels.2018.05.016

Pooja Jha, Molly T. McDevitt, Emina Halilbasic, et al. Genetic Regulation of Plasma Lipid Species and Their Association with Metabolic Phenotypes. Cell Systems (2018) doi:10.1016/j.cels.2018.05.009

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