當前位置:
首頁 > 新聞 > 代謝組學——腫瘤研究的利器

代謝組學——腫瘤研究的利器

乾貨 | 靠譜 | 實用

導 讀

20世紀90年代,衍生出了一門新學科:代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題:細胞到底發生了什麼?

細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的,代謝物更多地反映了細胞所處的環境,比如細胞現在是不是健康?藥物是否起效?環境污染物是不是正在傷害細胞?等等。由此,20世紀90年代,衍生出了一門新學科:代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題:細胞到底發生了什麼?

1

腫瘤與代謝組學

腫瘤在發生、發展過程中,有些特定的代謝過程。利用代謝組學技術監測這些過程中代謝物的變化或波動情況,就能早期診斷並預測腫瘤的進展。

Odunsi等人應用H-NMR、PCA及SIMCA 技術對38例卵巢上皮性癌,12例卵巢良性囊腫,53例正常婦女的血清的代謝物分析,對正常絕經前婦女、卵巢良性腫瘤和卵巢上皮性癌的識別率達100%,對絕經後婦女和卵巢癌的識別率分別為97.4%和97%,並且成功診斷出2例I期卵巢癌患者。

採用最新技術魔角自轉核磁共振分光檢定法並結合主成份分析(PCA),發現肝癌中乳酸鹽、谷氨酸、谷氨醯胺、甘氨酸、亮氨酸、丙氨酸和磷酸乙醇胺(PE)等代謝產物明顯升高,而甘油三酯、葡萄糖和糖原呈現出明顯的下降。這些代謝小分子簇可作為肝癌早期診斷和預後的生物標誌物。

肺癌是全球發病率及死亡率均位居首位的惡性腫瘤。80%的肺癌患者就診時已屬中晚期,僅能進行姑息治療,晚期患者5年生存率仍低於20%。近年來,代謝組學在肺癌中的應用也越來越廣泛。

Maeda等通過對141例非小細胞肺癌患者以及423例健康人氨基酸輪廓比較,提出氨基酸輪廓可作為非小細胞肺癌篩選的潛在指標。此外,對不同腫瘤分期和組織學類型(腺癌、鱗狀細胞癌和小細胞肺癌)的分析也獲得了同樣不錯的AUC值(AUC= 0.877),提示可能對患者進行早期鑒別。

肺癌患者的血脂水平降低。或許是因為癌細胞需要多餘的脂質來生長、增殖、氧化還原、侵襲和轉移。乙醯輔酶a羧化酶1(ACC1)是脂肪酸合成的關鍵調控因子之一,在NSCLC細胞中升高。ATP檸檬酸裂解酶(ACLY)的表達和活性也在NSCLC中被上調,這是另一種關鍵的脂肪酸合成酶。基於siRNA抑制ACLY表達對脂肪生成和細胞增殖有明顯的抑制作用。

Fearon等對肺癌的研究發現,在腫瘤細胞能量供應不足時,會加速間質細胞中的脂肪氧化生成酮體,再通過酮體轉運載體輸送到附近的腫瘤細胞,進而轉變成乙醯CoA,通過三羧酸循環和氧化磷酸化為腫瘤細胞提供能量。Csibi等研究發現,腫瘤細胞可以通過增強腫瘤間質細胞中的氨基酸降解,積累谷氨醯胺。谷氨醯胺對癌細胞的增殖和存活至關重要。

Sasano等人在乳腺癌內分泌治療的相關研究中,指出通過使用芳香化酶(尤其是17beta-HSDisozymes)抑製劑並監測瘤內其他酶系(尤其是STS)和相關微環境的變化情況,可以指導個體化的治療。

目前代謝組學在腫瘤診斷方面的研究主要集中在乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌,在肺癌、胃癌和食管癌等方面的研究也在逐步開展。無論在理論還是實踐,代謝組學在腫瘤的早篩,治療、鑒別診斷、預後評估等方面,都顯示出其無法比擬的優勢。

除了血液、尿液、組織,「一口氣」或許也可以是檢查的材料。呼氣實驗能檢測出幽門螺旋桿菌(HP),就因為HP具有較強的尿素酶,能分解胃中的尿素。來自歐洲學術研究院、德國科學院院士LotharWillmitzer 博士認為,今後簡單的一口氣,就能發現隱藏的身體疾病。實際上,的確有公司已經付諸實踐。2018年3月,位於英國劍橋市的Owlstone Medical公司宣布,已獲得李嘉誠領投的1500 萬美元融資,用來推動BreathBiopsy呼吸活檢平台的全球商業化。該呼氣活檢平台能針對包括肺癌、結直腸癌在內的8 種癌症進行的早期診斷試驗。

雖然代謝組學還只是在初生階段,但這幾年成為了研究熱點,液態體檢也正向著實用性方向發展。隨著代謝組學定量方法精確度的提高和研究的深入,以及各種組學數據的成功對接,人們可以獲得腫瘤基因轉錄、蛋白以及代謝水平的全景信息,從更高的層面理解生物系統的功能。包括質譜在內的多技術聯用,對代謝組學的發展提供了更加廣闊的空間。隨著代謝組學應用廣度和深度的不斷增加,人們戰勝腫瘤有了更多勝算。

2

代謝組學之番外篇:狗狗大醫生

狗狗能看家護院,也是許多人寂寞心靈的寄託。但是狗狗在腫瘤診斷方面的天才,也令人驚嘆!

1989年就有研究指出,狗能聞出癌症,後來陸續研究證明狗可以嗅出乳癌、皮膚癌及腸道方面的癌症。曾有報道利用狗的靈敏嗅覺判斷是否患肺癌,成功率高達7成。

英國《太陽報》也報道了英國第一批專業嗅癌犬之一「黛西」的神奇本領。它能嗅出滴入兩個奧運會標準泳池水量中的一滴血。「黛西」的工作主要是嗅尿查前列腺癌,不到一分鐘出結果。如果它認為有問題,就坐著不動,眼光轉向訓練員盯住不放。十多年來,它已檢測出550多例癌症病例,準確率達到93%。她還嗅出她的女主人患有乳腺癌。格斯特說:「如果不是『黛西』引起我的注意,我可能要到長成一個大腫瘤才知道,而當時腫瘤只有肉眼可見大小。」

研究人員深信,相信不少腫瘤都能產生異於常人的特殊物質。如果能將動物的特長結合代謝組學,也是一招妙棋。

-end-

國內公司業務有涉及代謝組的有:華大基因、SCIEX中國、上海敏芯、蘇州帕諾米克、上海阿趣、武漢安隆、詡基生物、騏驥生物等。

相關會議推薦

2018第二屆現代臨床分子診斷研討會將於2018年10月26-28日在復旦大學附屬中山醫院舉行。本次大會是臨床分子診斷領域重要學術研討會,延續首屆「講述自己故事,創新分子診斷」的大會主題,旨在為生物醫學領域的專家、青年學者和企業精英提供一個交流平台。

復旦大學附屬中山醫院院長樊嘉院士、中國科學院院士唐本忠教授、上海市衛健委科教處張勘處長、中山醫院臨床研究院執行院長王向東教授等行業大咖是本次大會的演講嘉賓。


喜歡這篇文章嗎?立刻分享出去讓更多人知道吧!

本站內容充實豐富,博大精深,小編精選每日熱門資訊,隨時更新,點擊「搶先收到最新資訊」瀏覽吧!


請您繼續閱讀更多來自 轉化醫學網 的精彩文章:

厲害了,20多家企業ctDNA室間質評滿分通過!
北京希望組正式面向全球提供基於PromethION平台的人類基因組重測序及生物信息學服務

TAG:轉化醫學網 |