乾貨系列——ITC操作手冊
應用範圍
蛋白質-蛋白質相互作用(包括抗原-抗體相互作用和分子伴侶-底物相互作用);蛋白質摺疊/去摺疊;蛋白質-小分子相互作用以及酶-抑製劑相互作用;酶促反應動力學;藥物-DNA/RNA相互作用;RNA摺疊;蛋白質-核酸相互作用;核酸-小分子相互作用;核酸-核酸相互作用;生物分子-細胞相互作用;
實驗時間較短(典型的ITC實驗只需30-60分鐘,並加上幾分鐘的響應時間),操作簡單(整個實驗由計算機控制,使用者只需輸入實驗的參數,如溫度、注射次數、注射量等,計算機就可以完成整個實驗,再由Origin軟體分析ITC得到的數據)。
測量時不需要製成透明清澈的溶液,而且量熱實驗完畢的樣品未遭破壞,還可以進行後續生化分析。
操作步驟簡單,總結起來就是上樣前洗滌反應池以及上樣針、設定程序開始反應以及數據收集、上樣後洗滌反應池以及上樣針、數據處理
一。洗滌
1.取出清洗連接器,將其插入到反應池中,上端與廢液瓶(錐形瓶)相連,廢液瓶與泵相連。將洗瓶中加滿水,連接器一端放入洗瓶中。
2.打開泵,將蛋白與配體及其相應buffer放入真空室中,蓋上蓋子。點擊左下角界面,點擊On為抽真空,點擊clean為清洗。
3.取出上樣針(針與針管分別放在存放盒中,拿出擰上即可)與滴定針,用水吸打至少50次。
4.清洗1-2個錐形瓶體積(約900ml),點擊clean,將連接在泵後的廢液瓶管口拔出,再將廢液瓶中廢液倒出。
二、上樣及參數設置
1.用上樣針將反應池中多餘廢液吸出,用buffer潤洗上樣針1-3次,再吸取buffer潤洗反應池1-3次,全部吸出。
2.用上樣針吸取300ul(體積可調整,最多500ul)蛋白至反應池中(吸取時注意不要有氣泡)。
3.用去離子水潤洗上樣針3-5次,潤洗後的上樣針吸取去離子水加入到參比池內,使水剛好溢出參比池口。
3.將黑色手柄垂直插入反應池上方,擰緊(有卡槽,放入時需將帶刻度一面偏右,邊向下插入邊向左擰緊至卡槽剛好卡住)。
4.打開電腦及NANO ITC儀(也可一開始打開),點擊電腦桌面上LunchITCRun,彈出界面點擊確定直至參數設置界面。(注意:在參數設置界面時,黑色手柄中刻度尺會開始校準,需要一定時間)
5.設置參數,一般為默認值(溫度:25℃,滴數:25滴,滴定間隔:120s),可根據實驗情況做調整。
6.參數設置左下角需填寫滴定針中樣品濃度與反應池中樣品濃度。
7.待右上角三角形變綠(即黑色手柄刻度尺校準完成)後,將黑色手柄取出。
8.滴定針用buffer潤洗1-3次,再吸取樣品50ul(注意不要有氣泡),將滴定針放進黑色手柄內,擰緊。再將帶有滴定針的黑色手柄插入反應池上方,擰至卡槽卡住。
10.開始後彈出頁面為保存路徑與填寫文件名。
11.將上樣針用水洗10次左右,針與針管分離,分別放入存放盒中。
三、結束後清洗
1.待反應結束後,將黑色手柄取出(注意慢慢垂直取出,不要讓滴定針碰撞反應池,以免滴定針歪)。
2.將上樣針取出安裝好,吸出反應池中液體,按清洗步驟清洗。
3.用上樣針將反應池中殘留液體吸出。
4.清洗完成後,將滴定針與上樣針分別放入存放盒放好,黑色手柄插入反應池上方。
5.關閉泵,NANO ITC儀。
6.在保存路徑中找出文件利用Lunch NanoAnalyze進行數據分析。
7.關閉電腦,清理桌面。
操作注意事項
一、操作相關
1.上樣針針頭較長較細,清洗及上樣時需注意盡量不要抵住較硬物體,以免弄斷。
2.清洗連接器連接好後,若沒有壓水至廢液瓶中,請檢查各部件是否密閉連接。
3.廢液瓶中廢液不得太多,以免被壓至泵中,對泵造成損害。
4.在清洗之前應準備好樣品,放入真空室中抽真空排氣泡,可邊清洗邊抽真空。先點擊On,再點擊clean。
5.各部件不用時需放入存放盒中,避免損壞。
6.黑色手柄帶滴定針插入反應池上方時一定要垂直放入,拔出時也要慢慢垂直拔出!
二、實驗相關
1.蛋白與配體buffer環境保持一致,如(1)存在DTT會干擾其真實的反應吸/放熱量(2)蛋白與配體PH不一致時,酸鹼滴定放熱量會干擾蛋白本身的反應吸/放熱量
2.蛋白與配體使用摩爾濃度
3.反應池中一般放300ul樣品,滴定針中一般放50ul樣品,當滴定數據不好時,可適當調整蛋白與配體的摩爾濃度
4.參比池一般放入300ul水,不用重新吸出,不要放入其他溶液
5.當ITC滴定圖雜亂時,可能是反應池未清洗乾淨,可適當用洗滌劑清洗,2ml洗滌劑加水至200ml,後多用水清洗
6.溫度、滴數、滴定時間間隔,滴定針轉速等一般為默認值,盡量不要自行調整,若實驗需要可適當調節。
特別感謝:周夢琦同學提供相關資料及經驗分享
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