科學家發現骨關節炎新基因位點

從父親遺傳的結構變異增加自閉症風險

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近年來，研究人員已經確定，第一次出現的基因突變——稱為「從頭突變」（de novo mutations），在自閉症譜系障礙（ASD）病例中約佔四分之一。在一項新的研究中，由美國加州大學聖地亞哥分校的科學家領導的一個國際研究小組發現了一個新的罪魁禍首，這個罪魁禍首或可解釋一些剩餘的風險：非編碼DNA區域中罕見的遺傳變異。

研究人員對2600個受ASD影響的家庭的9274名受試者的全基因組的自然選擇和分離畸變（transmission distortion）的證據進行了調查。在一個829個家庭的發現隊列中，在啟動子和未翻譯的區域內，結構變異體被耗盡，且父親遺傳的順式調控元件結構變異（CRE-SVs）優先地傳給受影響的後代，而不是其未受影響的兄弟姐妹。罕見的可遺傳的非編碼變異使兒童易受患ASD，父親和母親的貢獻各不相同。

Science 2018;360:327-331

脊椎動物RNA病毒的進化史

中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所張永振研究團隊使用大規模的Meta轉錄組方法開展了一項研究，在爬行動物、兩棲動物、肺魚、輻鰭魚、軟骨魚和無顎魚中發現了214種與脊椎動物相關的病毒。新發現的病毒出現在與脊椎動物感染相關的RNA病毒的每一個家族或屬中，包括了含有人類病原體的病毒，如流感病毒、沙粒病毒和絲狀病毒家族，它們的分支順序廣泛反映了其宿主的系統發育史。該研究為大多數脊椎動物RNA病毒建立了長期的進化史，並使用直系同源內源病毒元件來評估進化時間尺度（evolutionary timescales），以支持這一觀點。該研究還鑒定了新的脊椎動物特有的RNA病毒和基因組結構，並重新評估了媒傳RNA病毒（vector-borne RNA viruses）的進化。

綜上所述，這項研究揭示了脊椎動物整個進化史中多樣的病毒-宿主關聯。

Nature 2018;556:197-202

科學家發現骨關節炎新基因位點

骨關節炎的遺傳可能性約為50%，既往的遺傳學研究共鑒定了21個位點。英國謝菲爾德大學的Eleni Zengini等人進行了一項大型骨關節炎全基因組關聯研究（genome-wide association study，GWAS），使用了來自英國Biobank的1650萬個變異的數據。在對30727例病例和297191例對照進行再驗證研究和薈萃分析後，該研究團隊發現了9個新的骨關節炎位點，其中最有可能的具有因果關係的變異是非編碼變異。該研究建立了骨關節炎與高體重指數的因果關係，但未發現骨關節炎與甘油三酯水平或2型糖尿病的遺傳易感性之間存在因果關係。

在未來，大規模的全基因組測序研究應針對不同人群中表型良好的個體，並捕獲完整的等位基因頻率和變異類型譜，並進一步探究這種疾病的病因。

Nat Genet 2018;50:549-558

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