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高性能計算Lustre性能優化方案

談起HPC時,似乎繞不開Lustre。Lustre是HPC的代名詞,它是開源HPC並行文件系統市場佔有率最高的文件系統,並得到了如Intel和DDN等廠商的大力支持。目前,Intel與Lustre相關的業務已經被DDN所接手。

鑒於Lustre在HPC行業的知名度和認可度,今天,給讀者分享一篇關於Lustre調優的文章,目的是給Lustre學習者和愛好者提供些學習參考。

1 Lustre性能優化參考

1.1 網路帶寬

網路帶寬往往決定著lustre文件系統的聚合帶寬。Lustre是通過多個OSS同時讀取數據來提高系統整體的讀寫性能,然而,如果網路傳輸的性能過低,則無法發揮lustre文件系統的性能優勢。從以下幾點考慮網路帶寬對性能的影響:

網路類型(TCP/IP網路及Infiniband網路)

網卡類型(千兆網/萬兆網)

網卡數量及綁定方式(網卡綁定一起)

網卡綁定模式

補充:

通常情況下Infiniband網路性能遠遠高於TCP/IP網路,但成本較高

萬兆網比千兆網性能高

網卡綁定模式一般為6。

1.2 Lustre自身設置

Luster自身設置主要是條塊數(即OST的個數)及如何條塊化,這兩方面也是lustre實現I/O並發的關鍵。條帶化能夠使系統達到並發的目的,從而影響了系統的性能。Luster自身設置對系統性能的影響主要從以下幾個方面:

條塊大小(stripesize,min=64KB)

條塊數(stripecount)

起始塊數(start-ost,即條塊起始位置)

補充:

通常情況下start-ost默認為-1,不需要進行修改,該設置即不指定初始位置,能夠很好達到負載均衡的目的

通常情況下lustre條塊的大小的增加,聚合帶寬總體呈下降趨勢,當條塊過大時,某一時間內的多個I/O發生在同一個OST上,造成I/O等待,通常設置為64KB

通常情況下,隨著條塊數增加,聚合帶寬總體呈上升趨勢,在一定的環境下,合理的配置OST可以良好的發揮lustre的系統性能。

1.3 客戶端設置

Lustre文件系統中,客戶端生成一個全局存儲空間,用戶數據通過客戶端存入lustre文件系統中,所客戶端的設置也會影響系統的性能。

主要從以下幾點:

單個客戶端進程數(連接數)

讀寫塊大小

客戶端數量

補充:

隨著連接數(進程數)的增加,聚合帶寬開始呈上升趨勢,到一定程度後穩定(此時系統性能尚未達到飽和),隨著連接數的增加,帶寬開始下降

隨著I/O讀寫塊的大小增加,聚合帶寬開始呈現上升趨勢,到一定程度後穩定,隨後增加塊大小聚合帶寬反而下降,當64KB~64MB大小時,保持穩定

隨著客戶端數目的增加,讀模式下的聚合帶寬明顯提高,而寫模式下的聚合帶寬則變化不明顯。

1.4 存儲RAID

Luster底層存儲設備採用通用存儲設備,可以是單磁碟,也可以是RAID,也可以是LVP,大部分採用RAID方式,既能保證聚合存儲容量,又能提供數據保護。主要從以下幾點說明:

RAID方式(硬RAID/軟RAID)

RAID模式(RAID0/1/2/3/4/5/6/10/01)

硬RAID卡類型

做RAID的磁碟類型(SATA、SAS、SSD)

補充:

通常情況下,lustre文件系統底層採用硬RAID的方式進行底層存儲,性能遠遠大於軟RAID,但成本高

Luster通常做RAID6,提高數據保護

OST磁碟一般採用低成本的SATA盤,而MDS則一般採用SSD盤

2 Lustre小文件優化

2.1 整體設置

1、通過應用聚合讀寫提高性能,比如對小文件進行Tar,或創建大文件或通過loopback mount來存儲小文件。小文件系統調用開銷和額外的I/O開銷非常大,應用聚合優化可以顯著提高性能。另外,可以使用多節點、多進程/多線程儘可能通過聚合來提高I/O帶寬。

2、應用採用O_DIRECT方式進行直接I/O,讀寫記錄大小設置為4KB,與文件系統保持一致。對輸出文件禁用locking,避免客戶端之間的競爭。

3、應用程序盡量保證寫連續數據,順序讀寫小文件要明顯優於隨機小文件I/O。

4、OST採用SSD或更多的磁碟,提高IOPS來改善小文件性能。創建大容量OST,而非多個小容量OST,減少日誌、連接等負載。

5、OST採用RAID 1+0替代RAID 5/6,避免頻繁小文件I/O引起的數據校驗開銷。

2.2 系統設置

1、禁用所有客戶端LNET debug功能:預設開啟多種調試信息,sysctl -w lnet.debug=0,減少系統開銷,但發生錯誤時將無LOG可詢。

2、增加客戶端Dirty Cache大小:預設為32MB,增大緩存將提升I/O性能,但數據丟失的風險也隨之增大。

3、增加RPC並行數量:預設為8,提升至32將提高數據和元數據性能。不利之處是如果伺服器壓力很大,可能反而會影響性能。

4、控制Lustre striping:lfs setstripe -c 0/1/-1 /path/filename,如果OST對象數大於1,小文件性能會下降,因此將OST對象設置為1。

5、客戶端考慮使用本地鎖:mount -t lustre -o localflock,如果確定多個進程從同一個客戶端進行寫文件,則可用localflock代替flock,減少發送到MDS的RPC數量。

6、使用loopback mount文件:創建大Lustre文件,與loop設備關聯並創建文件系統,然後將其作為文件系統進行mount。小文件作用其上,則原先大量的MDS元數據操作將轉換為OSS讀寫操作,消除了元數據瓶頸,可以顯著提高小文件性能。

這種方法應用於scratch空間可行,但對於生產數據應該謹慎使用,因為Lustre目前工作在這種模式下還存在問題,操作方法如下:

3 文檔說明

Lustre文件系統的性能優化研究2011(王博,李先國,張曉)

基於軟RAID的lustre性能影響要素簡析2008(張丹丹,姚繼峰)

Luster I/O性能最佳實踐

Luster文件系統I/O性能的分析和改進(林松濤,周恩強,廖湘科)

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