JAMA：基因檢測不是「靜態」的，近1/4「意義不確定突變」被重新分類

近日，一項回顧了145萬人的遺傳性癌症基因測序結果的研究發現，近25%的「不確定重要性的突變」（variants of uncertain significance）之後被重新分類，其中大多數會降級為「良性」。

Theo Ross博士（左）和遺傳學顧問Jacqueline Mersch認為，遺傳諮詢並不是「靜態」的，基因檢測實驗室應該在獲得新信息時重新審查測序結果。（圖片來源：UT Southwestern）

9月25日，《Journal of the American Medical Association》期刊發表了這一篇題為「Prevalence of Variant Reclassification Following Hereditary Cancer Genetic Testing」的文章。來自於德克薩斯大學西南醫學中心的科學家們根據研究結果強烈建議：當科學知識得到發展、基因被重新分類時，基因檢測實驗室應該定期回顧其測序結果，並給醫生提供相關信息。

他們回顧145萬人的遺傳性癌症基因檢測結果發現，近25%的「不確定重要性的基因突變」隨後被重新分類——有些與癌症相關的可能性較低，有些與癌症相關的可能性較高。

基因突變源於細胞分裂，但是並不是所有的變異都與疾病有關，它們被分成「良性」、「可能良性」「不確定重要性的變異」、「可能致病」和「致病性的」。

「如果一個突變被重新歸類為致病性的，那麼對於患者而言意義是不同的。」文章作者、內科教授Theo Ross表示，「例如，如果患者攜帶一個Lynch綜合征突變基因，他們則需要一個不同的治療方案——在更早的年齡或者更頻繁的進行結腸鏡檢查；又或者如果攜帶BRCA突變基因，患者或許會選擇預防性手術或者接受超聲檢查等。」

典型的基因約包含27000個鹼基對（A-T，G-C），這些大量的鹼基對意味著無數的潛在變異。隨著高通量腫瘤測序和胚系基因檢測的廣泛應用，如何應對臨床意義不明確的基因突變，是大家面臨的挑戰之一。「我們一直在獲取新的數據，可能會發現有遺傳易感性的新家庭，並從他們的DNA突變中學習到新的知識。」 Theo Ross博士解釋道。

這項研究回顧了2006年-2016年間Myriad Genetics實驗室以及西南醫學中心癌症遺傳學項目的相關臨床數據。總體而言，24.9%的「不確定重要性的變異」被重新分類，其中大多數降級為良性。

這項研究提醒醫生需要知道關於基因突變的知識更新有多快，重新分類很常見。同時，獨立的商業型實驗室需要定期檢查基因突變數據，並提醒醫生注意重新分類。即便從「不確定」重新分類為「良性」，對於病人來說也很重要，因為可以讓他們安心。

責編：悠然

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參考資料：1）Genetic testing: Not a one-and-done deal

2）Prevalence of Variant Reclassification Following Hereditary Cancer Genetic Testing

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