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大腸桿菌基因組大改寫:重新編碼的細菌依然活著,但增長速度較慢

這是一種全新的生命形式嗎?來自英國劍橋大學科學家,以人工合成出基因組長度含400萬個鹼基對的大腸桿菌,徹底重寫細菌的DNA並砍掉一些冗贅遺傳密碼。研究人員指出,擁有新基因組的大腸桿菌根據一套全新生物學規則運行,生長速度比正常菌株稍慢,但很難區分出誰是天然細菌、誰是合成細菌。

細胞染色體中,控制某一性狀表現(比如大拇指能否彎曲、耳垂是否分離、單反皮或雙眼皮、發色為黑色或金色等)的DNA片段稱為基因,而一套染色體完整的DNA串列稱為基因組(包含基因和非編碼DNA),內有一個生物體攜帶的遺傳消息。

每個基因由一連串核苷酸組成,每個核苷酸由鹼基(A、T、C、G)、戊糖(即五碳糖)和磷酸三部分構成;DNA長鏈上連續3個核苷酸再形成一組密碼子(codon),每個密碼子決定一種胺基酸或終止信號,由胺基酸構成的蛋白質則負責執行各種功能,這些密碼子就是遺傳密碼(Genetic code)。

而劍橋大學團隊的實驗持續了2年,研究人員想知道如果剔除一些冗贅的遺傳密碼,是否會影響生物體。首先他們重新設計遺傳密碼,接著以化學方法合成,然後添加到大腸桿菌(Escherichia coli,簡寫:E. coli)DNA中取代原本的天然基因組,且剔除掉2組遺傳密碼,最終製造出含400萬個鹼基對的人工基因組,形成DNA代碼被徹底改變的新型微生物,稱為「Syn61」。

新型大腸桿菌增長速度比正常的大腸桿菌慢,領導這項研究的合成生物學專家Jason Chin指出,合成基因組可能會帶來一些好處,比如病毒無法入侵重新編碼過的細胞(編碼方式不同,但執行的功能都沒變),也可以讓科學家替細胞蓋一座「基因防火牆」,避免基因移到其他物種身上時發揮作用。

更或者,一個完全重新編碼的生命、具有全新化學成分的分子可能誕生。除現有已知的20種蛋白質胺基酸外,也許科學家能編碼新的密碼子,製造出能夠在體內執行新功能的新蛋白質。新論文發布在《自然》(Nature)期刊。

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