史上最大規模測序揭示:這些基因突變與2型糖尿病風險有關!
近日,通過一項史上最大規模全外顯子組測序分析,研究人員發現了四種與2型糖尿病風險相關的罕見變異基因。
這些基因和它們編碼的蛋白質是新葯的潛在靶標,可以指導研究人員更好地了解和治療疾病。
該研究成果已在英國頂尖學術期刊《自然》上發表。
我國是糖尿病大國。據《中國2型糖尿病防治指南(2017年版)》 顯示,我國18歲以上成人2型糖尿病發病率已達10.4%,60歲以上的老年人糖尿病患病率均在20%以上。
2型糖尿病是一種慢性代謝疾病,病因與患者的生活方式與遺傳因素有關,其中遺傳因素對發病起到重要影響。因此,找到2型糖尿病易感基因,將為疾病風險預測和治療方向提供依據。
此次研究團隊堪稱豪華,由牛津大學糖尿病醫學教授、麻省總醫院糖尿病科主任、哈佛醫學院醫學教授等百位醫學界大咖組成。
研究人員對近46,000人進行了全外顯子組測序分析,數據分別來自歐洲、非洲裔美國人、西班牙裔/拉美裔、東亞和南亞,這也是史上針對2型糖尿病進行的最大規模的外顯子組測序研究。
「研究大量來自不同血統的個體樣本很重要,之前多數大規模研究都集中在歐洲血統個體上,使用多樣化的數據可以使研究結果更加全面。」密歇根大學公共衛生院生物統計學教授米歇爾·波恩科解釋道。
全外顯子組測序,能夠檢測出所有基因的蛋白質編碼區域的變異。
尋找疾病突變基因的另一種方法稱為全基因組關聯研究(GWAS)。這種方法對於在整個基因組中發現常見疾病突變基因非常有效,但由於已知的大多數導致疾病的突變均發生在外顯子中,因此GWAS可能會錯過一些人類基因組中重要的罕見突變。
通過對大約21,000名2型糖尿病患者和25,000名健康對照者採集的數據發現,在7個基因點位上,有15個變體超出了全外顯子組差異效應的閾值,其中有兩個變體之前在GWAS中從未發現過。
基因變異的集中關聯分析結果顯示,有4個基因與2型糖尿病顯著相關。此外,研究人員還發現全外顯子組測序可以預測基因失活與T2DM風險的關係。
研究人員將全外顯子組測序結果與GWAS結果進行了對比,發現由全外顯子測序發現的2型糖尿病罕見變異信號可解釋的遺傳度遠超過GWAS。這也證明了全外顯子組測序對2型糖尿病基因突變檢測分析的重要性,它可以和GWAS達成很好的互補關係。
「我們現在已經了解了罕見DNA變異與2型糖尿病的關係。」該研究的第一作者、哈佛醫學院兒科助理教授傑森·法蘭尼克說,「這些變異基因為藥物開發提供了更有價值的信息。不管是作為新藥物標靶,還是用於疾病研究,它們都有著重要意義。」
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