科研人員對磷脂在土壤中的快速周轉研究證實了PLFA方法的經典假設
磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid, PLFA)分析是微生物鑒定和群落結構測試的重要方法。與核酸檢測相比,PLFA在表徵微生物活體細胞和精確定量微生物量方面具有明顯優勢。然而,PLFA方法是建立在一個經典假設的基礎上,即認為磷脂會隨著細胞死亡而迅速降解。遺憾的是,迄今磷脂在土壤中的降解速率從未被準確量化。中國科學院城市環境研究所研究人員選取細菌(大腸桿菌、甲烷氧化菌)和真菌磷脂作為研究對象,結合13C標記技術,分析了13C標記遊離磷脂在土壤中的周轉速率,測定了土壤微生物量及溫度等因素對遊離磷脂周轉速率的影響,在國際上首次證實了PLFA方法的經典假設。
首先,研究人員通過室內培養實驗發現,儘管添加的磷脂的種類及含量不同,但是13C-PLFA的變化呈現相似的趨勢(圖1),並且不同的磷脂脂肪酸也呈現相同的降解趨勢。根據模型擬合發現總磷脂脂肪酸的半衰期約在20小時左右,特徵脂肪酸的半衰期在14-27小時,不同特徵脂肪酸略有差異。
其次,不同土壤微生物量和培養溫度對磷脂脂肪酸的降解研究發現,土壤微生物量不是影響磷脂降解的限制因素,而溫度可顯著影響PLFA的降解(圖2),在該研究中發現低溫會增長磷脂降解的半衰期。
研究同時發現,在i15:0,14:0和16:1ω5c等PLFA中檢測到13C,表明試驗中可能出現二次同化。根據含量最高的特徵脂肪酸i15:0得出二次同化比例小於該成分的1%,因此該研究可以忽略二次同化對磷脂周轉速率測定的影響。
總之,該研究通過外源遊離磷脂結合13C標記分析磷脂種類、土壤微生物量和溫度對周轉速率的影響,對磷脂在土壤中的周轉過程進行了準確量化,證實了PLFA僅表徵活體微生物這一經典假設。
該研究於5月26日以High turnover rate of free phospholipids in soil confirms the classic hypothesis of PLFA methodology為題在線發表在Soil Biology and Biochemistry雜誌上(Vol 135, 323-330)。城市環境所研究生張迎迎、鄭寧國為論文共同第一作者,研究員姚槐應為論文通訊作者。該研究受到國家自然科學基金(41525002,41761134085)、國家重點研發項目(2017YFD0200102)和中科院戰略性先導科技專項(XDB15020301)的資助。
圖1 真菌的總13C-PLFA和特徵脂肪酸的13C 含量變化
圖2 不同溫度及土壤微生物量條件下13C-PLFA含量變化
城市環境所對磷脂在土壤中的快速周轉研究證實了PLFA方法的經典假設
來源:中國科學院城市環境研究所
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