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速覽 | 1個細胞+11位專家,第二屆單細胞測序技術高端研討會精彩瞬間

單細胞測序技術自2009年問世,早在2011年就被《Nature Methods》雜誌評選為年度值得期待的技術之一。而2013年,這一技術再次榮登《Nature Methods》雜誌, 被認為是年度最重要的方法學進展。同時,單細胞測序技術亦被《Science》評為2013年度最值得關注的六大領域TOP1。隨著測序技術尤其是高通量測序技術的迅速發展,10x Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等基於單細胞測序的高通量測序技術在2015年後陸續出現,徹底降低了單細胞測序的成本門檻。這讓單細胞測序技術被更多地應用於基礎和臨床研究,成為最炙手火熱的研究工具之一。

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在這一背景之下,6月29日,第二屆單細胞測序技術高端研討會在北京順利舉行。本次大會由清華大學醫學院、生物晶元北京國家工程研究中心、北京博奧晶典生物技術有限公司共同主辦,吸引了來自16個省市、39家醫院、41所科研院校的近350位參會者。

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2019第二屆單細胞測序技術高端研討會現場

會上,中國工程院院士、北京大學第三醫院院長、國家婦產疾病臨床醫學研究中心主任喬傑院士及其他10位來自北京大學、清華大學、中國科學院遺傳和發育研究所、北京生命科學研究所測序中心、同濟大學附屬醫院、10x Genomics和Miltenyi Biotec的專家學者們受邀出席並做了專題報告,報告主題圍繞單細胞測序技術在生殖及早期胚胎髮育、腫瘤診斷與個性化治療、大腦發育及神經幹細胞調控、動植物胚胎髮育以及單細胞測序數據應用方向。專家學者們分享了他們在各自的研究或工作領域裡應用單細胞測序技術的成果和經驗,並與參會者共同探討了單細胞技術應用中的觀點和思考。

臨床應用的思考與探索

本次大會的重量級嘉賓喬傑院士以臨床醫學的視角,解釋了單細胞測序技術是如何對生殖及早期胚胎髮育臨床疾病的認知產生進一步幫助的,並強調對此類疾病的診療不僅需要通過臨床實踐與基礎研究相結合,更需要依託像單細胞測序這樣的先進技術來探究疾病本質。

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喬傑院士

同樣作為臨床醫生,同濟大學附屬肺科醫院的吳鳳英副教授則以她自己的主要臨床研究方向——肺癌為例,重點講述了單細胞組學在癌症臨床醫學中的意義。她表示,精準醫療的實現,需要通過單細胞分析來準確定義腫瘤細胞和腫瘤微環境。

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吳鳳英副教授

基礎研究的前沿與轉化

國家自然科學基金委優秀青年基金獲得者、北京大學生物醫學前沿創新中心(BIOPIC)、生命科學學院研究員白凡在報告中分享了自己近年來在腫瘤幹細胞尤其是腫瘤循環細胞(CTC)和腫瘤異質性克隆起源研究方向上的主要成果。在他看來,通過單細胞技術對腫瘤微環境及腫瘤細胞異質性的探究具有不可或缺的積極意義。

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白凡研究員

中國科學院遺傳與發育研究所、中國科學院腦智卓越中心的吳青峰研究員主要從事幹細胞譜系追蹤和神經再生方面研究。在報告中,他重點論述了如何通過單細胞轉錄組研究神經幹細胞微環境以及如何通過識別細胞類型和建立細胞分類標誌物來進行細胞譜系重構,從而揭示下丘腦成體幹細胞的特徵與功能。

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吳青峰研究員

智能與高端平台的研製與開發

來自清華大學醫學院生物醫學工程系的劉鵬研究員和他所在的團隊致力於通過智能化和自動化的微流控和晶元技術手段,來解決傳統高通量篩選技術所面臨的挑戰。他們自主研發了一種基於超疏水原理的微孔陣列晶元平台並探索了將該平台與超分辨成像系統相結合的應用。在報告中,劉鵬研究員詳細介紹了如何通過該技術平台來實現晶元上的高通量細胞培養和對細胞的高通量化學/電轉染,以及如何實現基因表達譜測序樣本的高通量並行製備和超高內涵細胞成像分析。

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劉鵬研究員

來自北京大學生物動態光學成像中心的文路副研究員在報告中重點介紹了其團隊自主研發的單細胞三重組學測序技術(scTrio-Seq)。文路博士詳細講述了如何應用該技術實現對單個細胞中基因組拷貝數變異、DNA甲基化組和轉錄組同時進行高通量測序分析,並以直腸癌和胃癌的案例研究為例,系統解析了腫瘤細胞亞克隆的DNA甲基化異質性及其與轉錄組的關係。

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文路副研究員

結語

大會上專家學者們的報告給我們留下了無限的思考空間,也讓我們意識到基礎研究、平台研發和臨床轉化是緊密結合,缺一不可的。只有通過單細胞分析將細胞表型與全基因組表達深度融合,才能更深入地理解細胞的基因差異表達和進化,從而進一步推動對疾病分子機制的理解,對精準疾病藥物的篩選,以及臨床診斷與治療的發展。我們希望,單細胞測序技術在不久的將來能夠有更廣闊的研究和應用前景,繼續造福人類社會。

End

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