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研究揭示胰腺癌腫瘤-微環境高度異質性細胞特徵

胰腺導管腺癌(PDAC)被稱為「癌中之王」,早期診斷困難、治療效果欠佳、病死率居高不下,五年生存率僅為8.5%,具有很強的腫瘤異質性。為解決生命與健康領域重大醫學科學前沿問題,2018年,中國科學院—北京協和醫院健康科學研究中心成立。由中科院院士趙玉沛、周琪擔任科學顧問,中科院北京基因組研究所楊運桂團隊、韓大力團隊與北京協和醫院吳文銘團隊在健康科學研究中心支持下,為探究PDAC發生髮展的分子機制以及腫瘤微環境的調控作用,通過合作研究,利用單細胞轉錄組測序技術,系統鑒定並分析了PDAC病人和對照胰腺樣本細胞類型,闡明了胰腺癌腫瘤-微環境高度異質性特徵,揭示了腫瘤亞群細胞與浸潤免疫細胞間相互關係,提出了新的潛在治療靶點。

研究團隊通過對24例術前未經放化療的人胰腺癌組織的41986個細胞及11例對照胰腺組織的15544個細胞進行單細胞轉錄組分析,繪製了大樣本人胰腺導管腺癌細胞圖譜。首先,通過t-SNE 分析鑒定出胰腺癌組織中10類細胞:I型導管細胞、II型導管細胞、腺泡細胞、內分泌細胞、內皮細胞、成纖維細胞、星型細胞、巨噬細胞、T細胞和B細胞。通過CNV結合差異分析和功能富集,鑒定II型導管細胞是胰腺癌組織的惡性細胞。其次,利用軌跡分析研究了PDAC從癌前狀態到惡性狀態的基因表達模式,發現在PDAC進展過程中,包括ErbB和Notch信號通路在內的多個經典致癌通路被激活。特別是在腫瘤進展的晚期,細胞增殖和遷移的相關基因被顯著激活。另外,團隊在II型導管細胞中鑒定出具備高增殖、高轉移潛能等在內的七個細胞亞群。其中,亞群7(增殖性導管亞群)的特徵基因富集在細胞周期和細胞增殖相關通路。進一步,結合TCGA資料庫的PAAD數據集進行整合分析發現,腫瘤組織中增殖性導管細胞亞群特徵基因的表達水平與腫瘤浸潤T細胞的激活存在顯著的負相關性,病理切片染色也證明了這兩群細胞數量的關聯性,提示增殖性導管細胞的存在和活化T細胞的缺失可能共同導致PDAC患者的不良預後。

相關研究成果在7月4日以Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma為題在Cell Research雜誌在線發表。

該研究為探索胰腺導管腺癌的致病機制、揭示腫瘤微環境的作用提供了重要的組學資源,揭示了增殖性導管亞群抑制 T 細胞浸潤和活化的新機制,提出了CDK1,PLK1和AURKA等增殖性導管亞群標記物作為精準治療靶點的可行性,為胰腺癌精準診治提供了新的研究方向。該研究得到中科院戰略性先導科技專項、國家重點研發計劃、中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程、國家自然科學基金等的資助。

胰腺癌腫瘤微環境高度異質性細胞特徵

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