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蛋白質生物合成

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蛋白質生物合成

蛋白質生物合成的概念

蛋白質生物合成也稱為翻譯,是遺傳信息表達的最終階段,而蛋白質是遺傳信息表現的功能形式。

翻譯:將mRNA分子中的4種核苷酸序列編碼的遺傳信息,解讀為蛋白質一級結構中20種氨基酸的排列順序。

蛋白質的生物合成體系

反應體系:

原料:20種氨基酸模板:mRNA場所:核糖體氨基酸的「搬運工具」:tRNA酶與蛋白質因子:氨基醯tRNA合成酶、轉肽酶起始因子、延長因子、終止因子能量:ATP、GTP無機離子:K 、Mg2

(一)翻譯模板mRNA及遺傳密碼

1.mRNA是遺傳信息的攜帶者,是蛋白質合成的直接模板。

基本概念:

(1)順反子:遺傳學將編碼一個多肽的遺傳單位稱順反子。

(2)多順反子:原核細胞中數個結構基因常串連為一個轉錄單位,轉錄生成的mRNA可編碼幾種功能相關的蛋白質。轉錄後一般不需特別加工。

(3)單順反子:真核結構基因的遺傳信息是不連續的,mRNA轉錄後需要加工,成熟才成為翻譯的模板,一個mRNA只編碼一種蛋白質。

2.mRNA上存在遺傳密碼。

(1)概念:

密碼子:mRNA中每3個核苷酸組成一組,代表相應的氨基酸或翻譯起始、終止信號。

起始密碼:5』端AUG,編碼甲醯甲硫氨酸(細菌)或甲硫氨酸(高等動物)。

終止密碼:UAA,UAG或UGA(不編碼相應的氨基酸)。

(2)密碼數量:64個,表示氨基酸的密碼有61個。

(3)遺傳密碼的特點

連續性:

編碼蛋白質氨基酸序列的各個三聯體密碼連續閱讀,密碼間既無間斷也無交叉。

簡併性:

多個密碼可編碼同一種氨基酸,即一種氨基酸可由多個密碼錶示

編碼同一種氨基酸的多個密碼稱同義密碼。

其原因是由於密碼子與反密碼子之間存在不穩定配對(擺動性或搖擺性)。

通用性:

蛋白質生物合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用。

擺動性

反密碼與密碼間不嚴格遵守常見的鹼基配對規律,稱為擺動配對。

主要發生在密碼子的第3位(3』端)與反密碼子的第1位之間(5』端)。tRNA反密碼子第一個核苷酸(5』端)與mRNA密碼子的第三個核苷酸(3』端)配對時,除A—U、G—C外,還可有U—G、I—C、I—A、I—U等。

(二)核糖體是多肽鏈合成的裝置

1.構成

(1)原核生物中的核糖體大小為70S,可分為30S小亞基和50S大亞基。由16S rRNA, 5S rRNA,23S rRNA和蛋白質組成。

(2)真核生物中的核糖體大小為80S,也分為40S小亞基和60S大亞基。由18S rRNA, 5S rRNA,28S rRNA,5.8S rRNA和蛋白質組成。

2.功能

核糖體的大、小亞基分別有不同的功能。

(1)小亞基可與mRNA、GTP和起始氨基醯tRNA結合。

(2)大亞基具有轉肽酶活性;具有兩個不同的tRNA結合點

A位——受位或氨醯基位,可與新進入的氨基醯tRNA結合;

P位——給位或肽醯基位,可與延伸中的肽醯基tRNA結合。

(三)tRNA與氨基酸的活化

tRNA在蛋白質合成中攜帶氨基酸並保證氨基酸準確就位。

一種tRNA可攜帶一種氨基酸;而一種氨基酸可有數種tRNA攜帶,參與蛋白質的合成。

1.氨基酸的活化:氨基酸的羧基與特異tRNA結合形成氨基醯一tRNA,連接位置是tRNA的3』-C-C-A-OH,此過程由氨基醯一tRNA合成酶(特異識別氨基酸、tRNA)催化。

2.起始肽鏈合成的氨基醯一tRNA

原核生物:起始密碼只能辨認甲醯化的甲硫氨酸。

真核生物:與甲硫氨酸結合的tRNA至少有兩種。

3.通過密碼和反密碼的不穩定配對使氨基酸運到準確的位置。

(四)蛋白質因子

包括啟動因子、延長因子、終止因子。

蛋白質生物合成過程

翻譯過程從閱讀框架的5』一AUG開始,按mRNA模板三聯體密碼的順序延長肽鏈,直至終止密碼出現。整個翻譯過程可分為起始,延長,終止。

(一)肽鏈的合成起始

指mRNA和起始氨基醯一tRNA分別與核糖體結合而形成翻譯起始複合物。

該過程需要多種起始因子和GTP參加。(參與該過程的多種蛋白質因子稱為起始因子)

1.原核生物翻譯起始複合物形成

(1)核糖體大小亞基分離。

(2)mRNA在小亞基就位。

S—D序列AGGA與16S—rRNA 3』端UCCU互補。

S—D序列:原核生物mRNA起始密碼AUG上游約8—13個核苷酸部位,存在4—9個核苷酸的一致序列,富含嘌呤鹼基,如一AGGAGG一,為核糖體結合位點。

(3)起始氨基醯一tRNA的結合(甲醯蛋氨醯-tRNA)。

(4)核糖體大亞基結合。

2.真核生物翻譯起始複合物形成

(1)核糖體大小亞基分離。

(2)起始氨基醯一tRNA與小亞基結合 (蛋氨醯tRNA)。

(3)mRNA在核蛋白體小亞基就位。

(4)核糖體大亞基結合。

(二)肽鏈的延長

根據mRNA密碼序列的指導,依次添加氨基酸從N端向C端延伸肽鏈,直到合成終止的過程。

肽鏈的延長也稱為核蛋白體循環。

核蛋白體循環:肽鏈延長在核蛋白體上連續性循環式進行,每次循環增加一個氨基酸,包括以下三步:進位、成肽、轉位。

1.進位

指根據mRNA下一組遺傳密碼指導,使相應氨基醯-tRNA進入核蛋白體A位。

該過程消耗GTP.

鹼基配對 除A—u、G—c外,還可有u—G、I—c、I—A、I—u等。

2.成肽

是由轉肽酶催化的肽鍵形成過程。

肽鏈合成方向N端 C端。

3.移位 需要消耗GTP

核糖體沿mRNA從5』 3』移動一個密碼的距離

肽鏈長度預測:起始密碼AUG到終止密碼之間的密碼子數目。

(三)肽鏈合成的終止

1.當核糖體A位出現mRNA的終止密碼後,終止因子(釋放因子) 與其結合,多肽鏈合成停止。

2.轉肽酶起水解作用使肽鏈從肽醯一tRNA中釋放

3.mRNA、核蛋白體大、小亞基等分離等分離,重新利用。

釋放因子RF功能:識別終止密碼和誘導轉肽酶改變為酯酶活性起水解作用。

進而使合成的肽鏈脫落並促進mRNA與核糖體分離。

在體內合成多肽鏈時是多核蛋白體循環。

多肽鏈合成後還需要剪切、側鏈修飾、亞基聚合等加工修飾才能成為有功能的蛋白質。

蛋白質生物合成與醫學的關係

蛋白質生物合成是很多抗生素和某些毒素的作用靶點。它們通過阻斷真核、原核生物蛋白質翻譯體系某組分功能,干擾和抑制蛋白質生物合成過程而起作用。

抑製劑:抗生素、干擾素、毒素。

抗生素類(表1—1—10—1)。

表1-1-10-1 抑制蛋白質生物合成的抗生素類

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