科學家繪製肝癌藥物基因組學「藍圖」

8月1日，國際學術期刊Cancer Cell 在線發表了中國科學院生物化學與細胞生物學研究所惠利健研究組、中國科學院上海營養與健康研究所李亦學研究組、第二軍醫大學附屬東方肝膽外科醫院張海斌研究組以及南京大學醫學院附屬鼓樓醫院施曉雷合作的題為A Pharmacogenomic Landscape in Human Liver Cancers 的研究論文。該工作報道了目前最大的肝癌細胞模型平台和最詳細的肝癌細胞藥物基因組學。通過整合大規模測序和高通量藥物篩選數據，研究人員建立了肝癌中基因組變異與藥物響應的相關性，發現了新的治療靶點和分子標誌物（如圖）。

圖：肝癌細胞系平台的建立與藥物基因組學分析

近五年，李亦學研究組針對腫瘤藥物基因組學中遇到的小樣本大數據等挑戰，開發鑒定葯敏標誌物和預測藥效的演算法，並將其應用於腫瘤細胞系和小鼠移植模型。在這項最新的研究進展中，惠利健研究團隊將肝癌細胞系體外建立的效率提高到50%，構建了全世界最大規模的肝癌細胞系平台（包括50株新建立的中國病人來源的肝癌細胞系和31株發表的肝癌細胞系），並測試了90種藥物在81株細胞系中的響應情況。李亦學團隊負責生物信息數據分析，構建了81株細胞系的突變圖譜和表達圖譜，並通過整合細胞系藥物響應、基因組、轉錄組數據，發現了新的潛在的治療策略和分子標誌物。進一步的實驗驗證了部分侯選標誌物對藥效的影響，如：CTNNB1激活突變與抑制HDAC聯合致死，DKK1高表達與Sorafenib的敏感性等。

生化細胞所博士邱志欣、博士研究生章正濤和營養與健康所副研究員李虹為研究論文的共同第一作者，惠利健、李亦學、張海斌和施曉雷為共同通訊作者。該工作獲得中科院、基金委、科技部等資助。

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