朱夑元平定奢安之亂後分化土司勢力，為清朝改土歸流奠定基礎
明朝從萬曆朝以來可以說是戰亂不斷，除了萬曆三大征還有女真的崛起，國內的農民起義也是此起彼伏。土司的坐大和叛亂與明朝實行的改土歸流更使得雙方的矛盾到了不可調和的境地！因為遼東給明朝造成的禍患比較西南土司更加嚴重，明朝當時的邊疆戰略更加傾向於重北輕南！這樣，那些勢力膨脹的土司更加不把明軍放在了眼裡。
然後，叛亂的催化劑來了！
天啟元年（1621年），明朝在遼東戰場屢戰屢敗，加上明初設立的衛所制已經崩潰，明朝此時已經普遍採取募兵制。為了充實兵源，明朝不得已向全國範圍徵兵，四川的土司奢崇明心懷不軌，主動請求率兵3萬奔赴遼東。明朝見奢崇明如此忠心當即應允，不料奢崇明到達重慶後立即借口明朝剋扣軍餉發動叛亂，殺死四川巡撫後佔據重慶，並宣布建立「大梁國」。此時，貴州土司安邦彥也舉兵叛亂，自號「羅甸王」，一時間得到了水西一帶48個土司的響應！這就是明朝後期著名的「奢安之亂」。
有叛亂，就要有平叛！奢崇明在重慶舉旗後，遂即發兵圍困了只有2000防守的成都，時任四川布政使的朱夑元登上了歷史舞台，他動員全城軍民拚死守城，連續挫敗奢崇明土司兵鋒。
而遠在貴州的安邦彥也正在發兵攻打明朝重鎮貴陽城，但是被新任貴州巡撫王三善擊敗，大敗虧輸的安邦彥一路敗退到鴨池河。可是王三善發兵冒進，中了安邦彥的埋伏戰死。雖然王三善戰死，但是消息還沒有傳到朱夑元耳朵里，朱夑元以為王三善攜戰勝之威一定可以掃平安邦彥。於是，深受鼓舞的朱夑元擊敗崇奢明，一路追擊收復了重慶，奢崇明被打得入地無路，被追得跑到了安邦彥的地盤！這時，朱夑元才知道王三善已經戰死，叛軍勢力已經十分強大到48萬人。大明西南半壁立刻陷入了風雨飄搖之中！
自此萬分危急之時，明朝在各路兵馬大敗唯有朱夑元獨善其身的情況下，立即擢升朱夑元，給予了他大權，「以兵部尚書兼督雲南、貴州、廣西諸軍」，可以說給了朱夑元西南半壁皇帝之權！朱夑元遂即施展計謀平定奢安之亂！朱夑元戰略指導思想是剿撫並用，恩威並施！雖然明朝已病入膏肓，但是如果戰略對頭，將帥得當，掃平這股叛亂還是綽綽有餘的。同時，貴州巡按傅宗龍建議朱夑元「屯田戍守」的應對之策：一是先派兵攻佔安邦彥在鴨池河以東的軍事據點，在各個渡口修築工事，命令防守士兵練習水戰，奪取鴨池河天塹的控制權；二是對依附奢安的其他土司頭目實施圍剿和安撫；三是在耕種季節不斷派遣明軍渡河進行騷擾，使叛軍的糧食生產不能正常進行；四是在鴨池河沿岸進行大規模屯田，解決軍糧運輸困難的問題，以穩定軍心。
重新換了統帥的明軍連續擊敗奢安叛軍，崇禎元年（1628年）6月，明朝戰略準備完成，立刻調集了雲、貴、湖、廣、川5省軍隊向叛軍發起反擊，叛軍大敗，安邦彥與奢崇明被殺，其餘叛軍在安邦彥的侄子安位的帶領下繼續負隅頑抗。明軍乘勝包圍水西城，斷絕其糧食供應，逼安位投降。水西被圍100多天後糧盡。崇禎三年（1630年）春，安位投降。至此，持續近9年的「奢安之亂」終於平定。
明朝對待在奢安敗死後歸附的叛軍本著首惡必懲，脅從不問這一原則，安撫了人心。在此亂世之際，朱夑元深知國家已經無力徹底解決土司時代沿襲的特權，想出類似於漢代推恩之策，趁機多封土司，以達到分散其勢力的目的！朱夑元平叛穩定了西南半壁的局勢是毋庸置疑的，促進民族交流也是毋庸置疑的。他在平叛後，為各處土司劃定了疆界，明確各地土司不得隨意侵襲各自土地。這次叛亂也在某種程度上打開了閉塞的貴州與內地之間的交流。最重要的是，因為朱夑元將勢力龐大的土司分裂疆土，眾建土司，廢除了奢安土司施行的一切不合理苛政，收買了老百姓的人心，土司已經徹底衰落！為隨後清朝雍正、乾隆年間施行的改土歸流奠定了基礎！
