32天，他們創建了冠狀病毒資源資料庫平台
◎ 金鳳 通訊員 姜晨 姜佳彤
115例新型冠狀病毒感染兒童的臨床特點分析、武漢同濟醫院醫務人員2019新型冠狀病毒感染相關因素的病例對照研究、洛匹那韋/利托那韋對新型冠狀病毒肺炎患者血脂水平的影響……3月26日，記者從中國藥科大學獲悉，該校基礎醫學與臨床藥學學院2018級藥理學專業博士生孫慶榮帶領團隊成功開發出一個冠狀病毒資源資料庫。該資料庫平台整合了1.2萬餘篇中外有關冠狀病毒的相關文獻資料索引信息、病毒相關數據以及病毒研究相關分析工具，相關文獻跨越50多年的研究，團隊歷時32天攻關完成。
收錄50餘年來的冠狀病毒相關文獻信息
打開冠狀病毒資源資料庫網站，有關冠狀病毒研究的文獻、專利、數據資源一目了然。中國藥科大學基礎醫學與臨床藥學學院2018級藥理學專業博士生孫慶榮介紹，資料庫中的研究報告和綜述性論文，從1965年跨越至2020年，可以方便廣大學者便捷、迅速地查找包括新冠病毒在內的冠狀病毒的相關研究文獻，深入了解冠狀病毒的起源、研究歷史、研究進程、研究熱點等，促進藥學、化學、生物學等多學科的交叉融合。
「這些海量的文獻研究資料，資料庫沒有照單全收，我們剔除了一些評論性以及策略性文章，只保留了學術研究、學術綜述、病例解析、數據平台、分析工具等內容，以更好地集中有效學術資源。」孫慶榮說，冠狀病毒資源資料庫從建立到完善僅僅才32天，截至3月22日，資料庫里共收集了9556篇英文研究文獻、3052篇中文研究文獻的索引信息，25個英文數據資源平台、6個中文數據資源平台以及18個與病毒學相關的主要分析工具等等。
為何開發創建冠狀病毒資源資料庫？孫慶榮坦言，這一開發靈感主要來源於導師、中國藥科大學校長來茂德。疫情發生後，來茂德從醫藥大數據的角度鼓勵學生們多進行新冠病毒的相關研究，包括基礎的多序列比對、進化分析以及新冠病毒重要靶點ACE2蛋白的分析等。
將持續更新資料庫資源
說干就干，孫慶榮迅速與中國藥科大學藥學、臨床藥學、中藥學、生物製藥等多個專業的11位志同道合的本科生組建團隊，大家一起查閱文獻、整理資料、搭建網站……
孫慶榮坦言，冠狀病毒資源資料庫的建立，一波三折。資料庫伺服器基礎環境的構建、數據整合、信息展示等環節，都曾遇到過各種各樣的困難。
「資料庫伺服器基礎環境建設需要相關專業人員才能實現，數據的整合需要人工檢索、篩選，工作量巨大。還有一些圖書館資源的問題，也需要專業人士的幫助。除此之外，疫情期間均需要各自居家工作，由於團隊成員家庭網路的差異，大家的網路最優時段也不同，協調統一會有點難度。」孫慶榮說。
不過，辦法總比困難多，面對諸多難題。國內資源數量相對少，他們就採用人工檢索為主的方式逐一搜索中國知網和萬方資料庫的文獻；對於國外資源，他們採用API和人工檢索相結合的方法，實現數據的整合及入庫。
研發期間，資料庫還得到該校圖書與信息中心老師們的指導、支持。「團隊的建立、基礎環境構建、資料庫的測試，若是沒有老師們的幫助，根本完不成。」
孫慶榮說，未來，團隊還將不斷更新資料庫資源，加入更多數據分析以及與冠狀病毒相關藥物的數據資源。
來源：科技日報 文中圖片均由作者提供
編輯：岳靚
審核：朱麗
終審：冷文生
