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AI演算法將新冠病毒轉換成音樂,以研究破解其棘狀蛋白結構

新冠病毒大流行迫使全球各地實施社交隔離的非時常期,許多人轉而倘佯讓人緊繃身心為之舒緩的古典音樂悠揚音符里。但對科學家而言,音符也可能為研究這隻讓世界不支倒地的病毒提供新方法。麻省理工學院(MIT)研究人員使用一種稱為「信息聲音化」(Sonification)的技術,將新型冠狀病毒Sars-Cov-2的棘狀蛋白(Spike Protein,又稱S蛋白)轉換成音樂。

此音頻3月發布在音樂創作分享平台SoundCloud,目的是為了協助研究人員進一步了解新冠病毒的結構。新冠病毒去年底首次出現在中國,僅3個多月,就讓全球100萬人被感染。科學家說,隨著時間推移,這種音頻格式可協助開發新葯或找到抵抗病毒作用的抗體。

實驗的核心是棘狀蛋白(病毒表面成分,讓病毒外形猶如皇冠),外觀就如「冠狀病毒」(「Corona」拉丁文之意為皇冠)之名。這種蛋白質是病原體與宿主細胞的結合物,多半位於肺部,其結構和感染細胞的關係有助於理解病毒攻擊人體的運行方式。

人腦擅長處理聲音,愉悅音符可破解病毒狡詐特性

但是,為什麼選擇音樂而不是傳統的病毒比對方式?「我們的大腦非常擅長處理聲音。我們需要一台高倍率顯微鏡才能在圖像看到相同程度的細節,但我們不可能同時看到所有細節。聲音是一種獲取存儲在蛋白質信息非常優雅的方式。」負責這個項目的MIT教授Markus J Buehler 2日接受《MIT News》採訪時表示。

「我們也可能使用合成方法製作出可攻擊病毒的藥物。我們可找出能與棘狀蛋白結合抗體的旋律與節奏匹配的新蛋白質,進而干擾新冠病毒的感染能力。」Buehler補充。

還有更好的譬喻可說明為什麼科學家熱衷將病毒結構轉化成聲音。這種「令人愉悅放鬆的聲音」揭穿了「會劫持人體以擴大感染病毒的狡詐特性」,Buehler對長達約2小時音頻《冠狀病毒棘狀蛋白之病毒弦律對位》(發布至音樂共享平台SoundCloud)的簡介說明寫道。

「信息聲音化」過程包括將組成蛋白質的氨基酸指派至相應的聲音,方法是以特定音階對某音符移調固定頻率。至於蛋白質其他方面則通過改變音符的音量和音長表示,使之具節奏感。

通過AI人工智慧演算法,能將這些樂譜轉換成可顯示氨基酸與蛋白質結構「固有關係」的樂曲,根據Chi-Hua Yu、Zhao Qin、Francisco J Martin-Martinez及Markus J Buehler等研究人員於美國化學學會(American Chemical SocietyACS)刊物發布的方法論指出,他們提出「信息聲音化」過程的普遍性指導方針。

這不是第一項通過聲音感測微生物數據文件的研究。2017年一項將存儲在DNA串列信息轉換成音樂的研究認為,可幫助科學界分析複雜的結構及可能發生的任何突變。3月一位英國藝術家發布名為《Covid-19之聲》(Sound of Covid-19)曲子,儘管不具科學用途,但這位藝術家說,此為Sars-Cov-2基因組串列轉換而成的音符。

(首圖來源:Markus J Buehler / MIT News)

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